Hola QFDaniela y bienvenid@ al foro 
A ver, en principio lo que has hecho es correcto para “volver a hacer visibles” las carpetas y archivos ocultadas por el virus…
En principio una vez hayas utilizado el comando attrib del DOS, deberías intentar eliminar todas esas carpetas y archivos que seguramente te han aparecido y tu no habias creado… (las crea el propio virus)
Si no te deja escribir en el pendrive intenta hacerte una copia de los archivos que quieras salvar en una carpeta de tu disco duro con un copy/paste a ver si te deja leerlos… SI consigues hacer una copia de tus archivos en tu pc, formatea la memoria USB.
Para formatear la memoria usb vete a la consola del dos (INICIO/EJECUTAR/CMD.EXE) y escribe el siguiente comando:
FORMAT x: /FS:FAT32
(x=letra de unidad del usb) (FS:Sistema de archivo (FAT, FAT32, NTFS, etc)
[b]IMPORTANTE: ANTES DE FORMATEAR HAZ UNA COPIA DEL CONTENIDO DE LA MEMORIA USB!!! .
[/b]Si estás completamente segur@, al 100% de que tu memoria usb (pendrive) no tiene una pestañita para protegerla contra escritura sólo se me ocurre que tu sistema y no solo el pendrive haya sido infectado y que el virus se encuentra TSR (residente y activo en memoria) y por esa razón no te deja eliminar los archivos ni escribir en el pendrive…
Mira los procesos activos en memoria y adjunta una captura por si veo algo raro…