Dorime.
Como te dije antes, esos programas que no se pueden scanear porque " estan siendo usados ", es muy comun.
Puedes mantener CCleaner es muy bueno para borrar la basura y tiene otras buenas funciones. Lo que tienes que tener cuidado es con el limpiador de registro.
Malwarebytes’ ( MBAM ) es muy bueno para una segunda opinion, barrido rapido. Mantenlo actualizado manualmente cada dia o un dia si uno no. Normalmente MBAM tiene de 3 a 4 actualizaciones por dia pero el gratis no las hace automaticamente.
El problema del USB que se desconecta y las carpetas que aparesen o no puede ser indicacion de malware, systema de archivos corruptos, o un hardware mal desinstalado.
No se que Windows usas pero ve a " Administrador de Dispositivos "; PC > Propiedades > Hardware. Ve si algo esta en amarillo o rojo. Esto seria para buscar inconsistencias con el hardware instalado.
Para chequear por archivos corruptos haz un CHKDSK. Te dejo este sitio web explicando. Es lo mismo para todos los Windows. Tambien se tarda el chequeo ten paciensia.
http://www.todoprogramas.com/trucos/windows7/comousarelchkdskparalacomprobaciondeldiscoenwindows7
Hay otro chequeo, sfc /scannow, pero necesitas tener el CD de instalacion de Windows y es diferente el procedimiento para cada Windows.
Para asegurarte de que no tienes una infeccion es mejor buscar ayuda de expertos. Si sabes ingles abre un topico nuevo en " Viruses and Worms " aqui en Avast donde essexboy te ayudara:
Primero lee e instalas los programas que te piden aqui:
Malwarebytes’ ( ya lo tienes, pero actualizalo y haz un scan nuevo )
OTL ( tienes que seguir las instrucciones )
aswMBR.exe ( sigue las instrucciones )
http://forum.avast.com/index.php?topic=53253.0
Sus resultados los anexas como .txt, Busca " Additional Options… " al final del post cuando lo estes escribiendo y abre un nuevo topico aqui:
http://forum.avast.com/index.php?board=4.0
Te aconsejo hacerlo aqui en Avast porque es rapido, el mas rapido que conosco. En otros sitios se tardan hasta tres dias para contestarte. Asi que buscate un amigo que sepa ingles y pa’ lante.
Si no tienes que abrir un topico de ayuda aqui:
http://www.forospyware.com/foro-de-virus-y-spywares/
El unico sitio de confiansa en español que se que es bueno y seguro.
Suerte.