Раньше Avast Emergency Update включался в работу только тогда, когда были обнаружены проблемы в работе антивируса. Можете попробовать последнюю бета-версию, в ней я не наблюдаю ни папки Setup\emupdate, ни файла в автозагрузке, скорее всего работа данной технологии была изменена.

Отличия этих двух инсталляторов заключается в том, что один из них avast_free_antivirus_setup_online_fdi-a является онлайн-установщиком (все необходимые компоненты будут загружены с сервера аваст, соответственно, требуется подключение к интернету), а другой является полным(не требуется подключения к интернету).