А зачем удалять старую версию скайпа ? Запустите скайп.Зайдите в него,проверьте в нём обновления.И если новая версия есть,то там прямо в рабочем и обновляйте.Она сама загрузится,сама обновится и скайп сам сделает перезагрузку.Вводите пароль и скайп уже работает на новой версии.Ну,а если вы сами скачаете новую версию,то сразу запускайте её на установку с правами админа.И она запустится,и установится прямо на старую версию.И ничего не надо удалять.Так можно со многими прогами делать.Есть правда проги,которые таким методом могут и не обновиться.Тогда тут только удалять и устанавливать с нуля.