Вирус Win32.Malware.gen активировался в момент подписания платежки в клиент-банке и съел все ключи и всю инфу на флэшке. Флэшка пустая. Значит ли это, что кто-то теперь сможет зайти в мой клиент-банк и сделать оплату, подписавшись моими ключами оформить платеж??? Или же просто вирус уничтожил всю информацию на флэшке и в дальнейшем небудет их использовать?

BestLady, здравствуйте! Добро пожаловать на форум!
Не исключено, в любом случае, свяжитесь с банком. Хотел уточнить: объем занятого места на флешке равен 0? Возможно, вирус просто скрыл все файлы на флешке.
Подготовьте отчеты OTL и Malwarebytes anti-malware по инструкции: http://forum.avast.com/index.php?topic=100566.0 и прикрепите их в следующем сообщении.